Er wordt de laatste jaren steeds meer aandacht besteed aan hygiëne bij de teeltwisseling. Vervanging van stekers of zelfs complete druppelslangen is steeds meer een aandachtspunt  om aantasting van de nieuwe planten met Verticillium, Fusarium of Phyptophtora  te voorkomen.
De laatste jaren worden er steeds meer vakken tussen geplant. 

Dit vraagt extra aandacht voor het reinigen van de teelt- en druppelsystemen en voor de gezondheid van de bestaande vakken.
Het begint met het verwijderen van alle organische resten uit het hele teeltsysteem inclusief de draingoten. Hierbij moet stofvorming te allen tijden voorkomen worden. Sporen van bijvoorbeeld  Verticillium kunnen met bladblazers tot diep in de kas verspreid worden.

Bij het  reinigen van het teeltsysteem  is het vooral van belang dat het reinigingsmiddel overal komt en voldoende lang nat blijft. Het gebruik van schuimpistolen is een duidelijke verbetering door betere hechting aan oppervlaktes.  Probeer de inwerktijd te verlengen door vroeg in de  ochtend of juist in de avond te desinfecteren. Kan dit niet, probeer dan het verduisteringsdoek deels te sluiten om instraling beperkt te houden.

Druppelsystemen moeten zowel aan de binnenkant als aan de buitenkant ontsmet worden. Echter dit volzetten met zuur en/of chloor en afspuiten dit is voor de stekers onvoldoende. De stekers worden alleen volledig ontsmet als ze minimaal 24 uur in een oplossing van 3% waterstofperoxide of 3 % zuur of 3 % trinatriumfosfaat gestaan hebben.